提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
中国驻菲律宾大使馆“欢乐春节”活动走入菲职业篮球联赛******
中新网1月16日电 当地时间15日晚,中国驻菲律宾大使馆与菲律宾篮球协会(PBA)在菲律宾职业男子联赛委员杯决赛期间共同举办“欢乐春节”活动,黄溪连大使、菲律宾篮协主席马歇尔及菲有关政要等出席活动,约5.5万余名球迷现场观赛并参与其盛。
本次活动系“欢乐春节”品牌活动首次走入菲律宾热门体育赛事。篮球是风靡菲律宾全国的第一大体育运动,PBA委员杯、总督杯等赛事吸引了全菲千万球迷关注和热捧。当晚PBA委员杯在Philippine Arena体育场举办决赛决胜场,对阵双方为来自中国香港地区的PBA特邀球队湾区翼龙队和菲律宾老牌劲旅巴朗加国王队,现场观众在喜庆祥和的中国年味与紧张刺激的比赛氛围中共同度过一个“文化+体育之夜”。本场活动也标志着今年“欢乐春节”系列活动在菲正式启动。
比赛开始时,在现场球迷共同注视下,黄溪连步入球场中央为两支队伍开球,预祝双方团结拼搏、勇创佳绩。在热身阶段,球场环形大屏幕专门播出了“欢乐春节”视频,充分展现中国春节的深厚历史渊源和文化内涵,展示中国、菲律宾等世界各国民众欢庆春节的丰富形式与民俗,祝贺广大菲律宾民众新春快乐、吉祥如意!中场间歇,使馆为现场观众准备了熊猫和福兔毛绒玩具、中菲友谊T恤衫等礼物。随着满载中菲友谊和新春祝福的礼物被一件件抛出,现场气氛掀起一个又一个高潮。
中国驻菲律宾大使黄溪连等嘉宾与球员合影。 中国驻菲律宾大使馆供图此外,在PBA委员杯决赛阶段的其他场次,驻菲使馆还将舞狮表演引入赛事,为参赛队伍加油助威,与全场观众同庆“欢乐春节”。伴随着欢快的锣鼓点,几只瑞狮腾跃翻飞、千姿百态,表现出这一中国传统民俗祥和、欢乐、昂扬之美,传递中国春节和合共生的良好祈愿。
本场赛前,黄溪连大使与菲篮协主席马歇尔就中菲人文交流、体育合作等内容交换了意见,使馆文化参赞李薇等陪同出席了有关活动。使馆外交官、在菲中国留学生和中企代表等还组成啦啦队,赴比赛现场为湾区翼龙队加油助威。
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() |